新冠病毒被命名为SARS-CoV-2是真的吗?

时间:2020-02-14  点击:
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  网传消息:新冠病毒被命名为SARS-CoV-2。

  鉴定结果:属实

  

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  权威解读:

  对病毒进行命名的机构,也就是国际病毒分类委员会(International Committee on Taxonomy of Viruses, ICTV),其下属的冠状病毒研究组(Coronavirus Study Group,CSG)在刚发表于BioRxiv上的预印本文章,将WHO暂时命名的新型冠状病毒2019-nCoV正式命名为SARS-CoV2。国际病毒分类委员会(ICTV)是病毒分类的权威机构,是世界各地进行病毒相关科研所依据的标准命名。查证者:病原生物学博士 Vigorous Cooler

  延伸阅读:

  先上张图:

  

  ICTV对冠状病毒的分类

  ICTV的官网截图并不清晰,我将冠状病毒相关信息摘出如下:

  

  官网截图1

  可以看到,冠状病毒的上级分类是目(order),下级有科(family)、属(genus)、种(species)。

  

  官网截图2

  而现在讨论的SARS-CoV2是一个比种还要小的概念。

  来自国际病毒分类委员会(ICTV)冠状病毒研究组(Coronavirus Study Group,CSG)发表在冷泉港预印本杂志bioRxiv上 的一篇文章对现在正在流行的新型冠状病毒及其引起的疾病进行了阐述。

  Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus – The species and its viruses, a statement of the Coronavirus Study Group. doi:

  

  冷泉港预印本杂志

  ICTV的冠状病毒研究组(CSG)是制定冠状病毒科病毒分类名称的官方机构。通过系统进化分析,CSG认为新冠状病毒是SARS冠状病毒(SARS-CoV)的姊妹病毒,同属于SARS相关冠状病毒(SARSr-CoV)这个种的范围之下。并且将之正式命名为SARS-CoV-2。为了进一步促进交流,CSG还建议后续分离的病毒毒株(isolate)用这样的命名方式:SARS-CoV-2/Isolate/Host/Date/Location,也就是SARS-CoV-2/分离株/宿主/时间/地点,按照这个格式,如果2020-0212日在武汉一位病人中分离到一株病毒,就可以称之为SARS-CoV-2/Isolate X/human/20200212/Wuhan。

  而之前,CSG这个小组制定冠状病毒内部亚科、属、亚属和种的分类依据是氨基酸残基的重复替换(PPD)和占所比较蛋白质中氨基酸的百分比(PUD),也就是说,对于种来说,替换的氨基酸占比在2.1%~2.3%之内的算同一个种。

  

  冠状病毒科内各此分类划分标准

  根据分离到不同毒株的信息进行物种成对距离划分,其实可以看到,SARS-CoV下不同毒株的差异并不比猪流行性腹泻病毒(PEDV)、中东呼吸综合征病毒(MERS-CoV)和传染性支气管炎病毒(IBV,针对禽类的冠状病毒)大。而再对SARSr-CoV进行分类,可以看到SARS-CoV2与SARS-CoV相互之间的差异又比较明显,所以,ICTV-CSG认为“新型冠状病毒”属于SARS样冠状病毒种,但是与SARS-CoV又不一样,属于另一个毒株。

  

  物种成对距离划分

  所以,ICTV-CSG根据现有的序列分析,认为“新冠状病毒”并非一个“新病毒”,而只是改头换面变了一些氨基酸卷土重来的毒株,并不能作为一个新的“种”来定义。

  

  新冠病毒的分析

  CSG为了大家便于理解,还专门制作了一个冠状病毒分类与人在分类学上的概念的类比,也就是说,在这次的SARS样冠状病毒下不同的病毒株,就类似于同属于人类的不同的人一样。

  

  病毒分类与人的类比

  作为病毒学研究人员,我个人是赞同这样的分类的。

  前期报道有人提到就像登革病毒分四个型别,DENV-1,DENV-2,DENV-3和DENV-4。这次在人间又一次出现的新型冠状病毒和SARS-CoV的类似性和差异性,表明了是其先祖的又一分支在人间又一次成功传播。所以从分类学的角度是非常容易理解ICTV-CSG这样的命名。但是后续是不是会有其他因素影响这样的命名不好下结论。

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