全记录!上海首例新型冠状病毒在这个实验室被诊断|上海
原标题:全记录!上海首例新型冠状病毒在这个实验室被诊断
上海市疾控中心病原检测团队严格筛查样本。本文图片均由 上海市疾控中心 供图
2020年1月20日晚,国家卫生健康委确认上海市首例新型冠状病毒感染的肺炎确诊病例。
从无到有,上海是如何经过层层把关最终确认的呢?
2月1日,上海市疾控中心对外发布上海市首例新型冠状病毒实验室诊断诞生全记录,这其中离不开上海市疾控中心病原检测团队的努力。
早在2019年12月底,武汉出现不明原因肺炎的消息开始在社会上散播时,上海市疾控中心病毒检测实验室主任接到病原生物检定所所长指令后,带领团队开始着手一系列事情:梳理应急试剂储备量、拟制可能需要开展的工作计划,部署具体环节,做好随时迎接应急指令下达的准备。
2020年1月7日,中国疾病预防控制中心发布武汉首例新型冠状病毒感染病例。
此时,距离新春假期只有2周的时间,如果是往常,大多数人早已拟定了返乡和出游计划,或归心似箭、或心向远方了。而病例的公布,仿佛吹响了全国的战斗号角,一切都随之而紧绷起来。
上海市疾控中心病细致分析实验数据。
实验室团队密切跟踪事态发展,调动“人”和“物”进入作战状态:对人,重申应急值守制度,节假日期间留守加班的思想动员,调整值班人员组合,加强力量配备;对物,启动应急试剂采购。
硬件齐备了,更重要的是“软件”也得跟上:团队边做边摸索,对几次送来的应急筛查样本,细致分析实验数据,谨慎研判实验结果,反复确认高通量快速实验室检测方案,并将其纳入上海市整体防控方案……一次次的检测都排除了新型冠状病毒感染事件。
2020年1月16日,实验室灯火通明。通过反复验证结果,确认新型冠状病毒核酸检测呈现弱阳性——这很可能成为上海首例疑似病例——事关重大,团队毫无迟疑,立即向中心领导上报了结果。
是或不是?面对此次来势汹汹的新型病原体,实验室也是充满了忐忑,慎之又慎——全国还未公布稳定可靠的核酸鉴定方法,如何才能确证?
上海市疾控中心病原检测团队将样本送到国家疾控中心。
根据国家疾病预防控制中心下发的2019年疑似新型冠状病毒肺炎防控方案,样本需要通过全基因测序,序列比对高度同源才能作为疑似病例上报国家疾控中心,首例疑似病例更是需要国家疾控中心复核才能公布。
得益于“三年行动计划”建立的二代测序平台,团队立即开展从标本中直接测序。
经过整整两天两夜的核酸提取、测序、生信分析,并将样本上送到国家疾控中心,终于完成了首例复核所需要的所有工作,并得到了国家疾控的回复:上海市疾病预防控制中心送检的1例疑似2019新型冠状病毒肺炎患者呼吸道标本3 份,经对送检标本进行核酸复核检测,结果均为 2019 新型冠状病毒阳性。
至此,首例新型冠状病毒实验室诊断最终完成。
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责任编辑:祝加贝
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